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交替氧化酶(alternative oxidase,AO)也稱抗氰氧化酶(cyanide resistant oxidase)。它廣泛存在於高等植物及部分真菌和藻類中,是植物體線粒體內膜上的線粒體呼吸鏈中抗氰呼吸途徑(cyanide-resistant respiration pathway)的末端氧化酶。其作用是將UQH2的電子經FP傳給O2生成H2O。其P/O為1。該酶不為氰化物等所抑制,易被水楊基氧肟酸所抑制。交替氧化酶的分子量為27×10^3~37×10^3,是一種雙鐵羧基蛋白(di-iron carboxylate protein),Fe2+是其活性中心的金屬。它不僅具有其它雙鐵羧基蛋白共有的結構特點以及去除分子氧的功能,更重要的是它還可以通過改變自身結構等方式來主動調節抗氰呼吸途徑的運行程度,進而調節細胞多方面的代謝和功能,以適應環境條件的改變,增強植物適應各種逆境的能力,調節植物生長速率,並與細胞凋亡和光合作用相關。

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