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歐洲生物信息研究所

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1 歐洲生物信息研究所 -歐洲生物信息研究所 EMBL-EBI

  歐洲生物信息研究所(EMBL-EBI)全稱EMBL - European Bioinformatics Institute,是一個非盈利性的學術機構,致力於以信息學手段解答生命科學問題。該所建立於1994年,位於英國劍橋南部的維康信託基因園,是歐洲分子生物學實驗室(EMBL,全稱EuropeanMolecular Biology Laboratory)的一部分。

  歐洲生物信息研究所為科學界提供免費生物信息資源、促進基礎研究、提供培訓和傳播行業尖端技術。歐洲生物信息研究所管理和維護著多個大型生物信息公共資料庫, 跨基因組學,蛋白質組學,化學信息學,轉錄組學,系統生物學等,同時創建了多種工具供讓研究人員分析和分享信息。歐洲生物信息研究所提供最優質的研究環境、無數跨學科的合作機會以及遍及世界各地的培訓課程。

主要任務

  (1) 為科學界建立和維護生物學資料庫, 提供免費的數據和生物信息服務, 支持生物學數據的存儲和挖掘,促進科技進步;

  (2) 通過生物信息學的基礎研究繼續推動生物學發展;

  (3) 為各個層次的科學工作者提供生物信息學培訓;

  (4) 支持幫助邊緣尖端科技成果向工業界的轉化;

  (5) 協調歐洲生物數據的提供。

主要服務

  歐洲生物信息研究所擁有超過20年生物信息學研究和服務經驗,是全球收集和傳播生物數據、提供免費生物信息服務的歐洲節點。該所管理維護著世界最全面的分子生物資料庫,其中很多是生物學家熟悉的資料庫,例如ENA(核酸序列資料庫),ENSEMBL(基 因組),ArrayExpress(基因表達數據),UniProtKB蛋白質序列,InterPro(蛋白質家族/域/蛋白指紋等)和PDBe(大分子結 構)。ENA由原EMBL-Bank核酸序列資料庫基礎上發展起來,是歐洲最重要的核酸序列資源,與美國NCBI的GenBank和日本的DDBJ組成國際核酸序列資料庫合作聯盟(INSDC)。這三大資料庫各自收錄了世界上所報道的所有序列數據的一部分,並且每天實時更新交換各自的序列信息。

  歐洲生物信息研究新的數據資源包括intact(蛋白質相互作用),Reactome(反應途徑)、ChEBI(小分子)等等,能幫助研究人員了解構建一個有機體的分子部分,以及這些部件如何結合起來建立系統。其它還包含文獻資料庫、專利數據資源、BioModels,Gene Ontology等等。每個資料庫的細節有所不同,但都堅持相同的服務原則。

  歐洲生物信息研究所向全球提供免費的生物信息服務,發展和維護著多種用於瀏覽、檢索、分析處理生物數據的工具服務。數據獲取工具SRS(序列檢索系統)為用戶提供了快速、便捷和友好的界面以搜索超過400個局域和公眾資料庫中大量不同種類的生命科學類數據。序列數據搜索包括FASTA、 NCBI BLAST和WU-BLAST序列同源性和相似性對比工具。其它還包括蛋白功能分析,序列多重排比,進化樹分析,大分子結構分析與多維顯示等。

研究興趣

  歐洲生物信息研究所為生物信息學提供了一個優質而獨特的研究環境。該所研究興趣廣泛,研究與服務相輔相成。作為一個EMBL不可分割的一部分, 歐洲生物信息研究所是EMBL的活躍研究成員。研究小組旨在通過研究開發新方法來解釋闡述生物數據,了解其生物學的意義。服務隊伍在維護和加強現有數據資源的同時研究開發新的服務內容。

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