1蛋白質組

蛋白質組是指組織或細胞中所有的蛋白質。自己1994年提出概念以來,對它的研究已逐步走向深入。蛋白質組學系統地、大尺度地研究一個器官、組織或細胞中表達的是什麼蛋白質,而且要研究這些蛋白質的動態性質,如修飾等。
與基因組學相比,它是一個動態的概念。
蛋白質組的內容大於基因組,特別是在真核生物中,可想而知,蛋白質的數量大於基因的數量是由於RNA在進行轉譯時有剪接(Splicing)的作用,在後轉譯修飾時蛋白質特殊部位會有磷酸化或糖基化的作用。

2蛋白質組學

和蛋白質組有關的研究,稱作蛋白質組學(Proteomics),以前最常用在從粹取物中分離蛋白質的方法是 二維電泳(2DE,or 2-D Electrophorensis),二維電泳的第一維過程中,蛋白質依其等電點的不同被分離開來,第二維的過程是用SDS-PAGE將蛋白質依分子量的不同加以分離,電泳結束后可將膠片以銀染或Coomassie Blue的方式染色,讓蛋白質顯現出來。現在這種方法已經慢慢退出歷史的舞台,而基於色譜分離與質譜的大規模蛋白質鑒定技術已成為蛋白質組學研究的中心。這種技術可以大規模地對蛋白質進行分析,通過質譜儀把蛋白質或肽段的組成信息以一級圖譜與二級圖譜的形式表現出來,最後把這些圖譜與蛋白質或肽段產生的理論圖譜相比較確定相似性(也即搜庫),並最終確定樣品中包含那些肽段,並通過肽段與蛋白質的對應關係,最終推斷樣品中包含的蛋白質。
隨著蛋白質組學的發展,定量蛋白質組學(比較蛋白質組學)也獲得了廣泛研究。它不僅檢測基因表達的全部蛋白質,而且要檢測其表達蛋白質的含量。定量蛋白質組學的主要研究內容可以說是蛋白質定量技術,而這種技術是生物標誌物發現的重要途徑。
總體來說,蛋白質組學現在只是一種工具,且這種工具還存在許多未解決的問題。
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